Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nop56Q9D6Z1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Nop56Q9D6Z1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Nop56Q9D6Z1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Nop56Q9D6Z1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Nop56Q9D6Z1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Nop56Q9D6Z1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nop56Q9D6Z1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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