Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb4aQ9D6F9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms