Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc81Q9D5W4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc81Q9D5W4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms