Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pus10Q9D3U0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pus10Q9D3U0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms