Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Stag1Q9D3E6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag1Q9D3E6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag1Q9D3E6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag1Q9D3E6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag1Q9D3E6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag1Q9D3E6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag1Q9D3E6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag1Q9D3E6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag1Q9D3E6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag1Q9D3E6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Stag1Q9D3E6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms