Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Q9D2Q3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Q9D2Q3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms