Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim42Q9D2H5 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Trim42Q9D2H5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim42Q9D2H5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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