Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Batf3Q9D275 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Batf3Q9D275 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms