Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Serpinb3bQ9D1Q5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Serpinb3bQ9D1Q5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms