Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Mrpl53Q9D1H8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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