Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q9D1F3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q9D1F3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Q9D1F3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Q9D1F3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms