Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Zbed3Q9D0L1 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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