Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gtf2e1Q9D0D5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gtf2e1Q9D0D5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms