Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
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Xrcc3Q9CXE6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Xrcc3Q9CXE6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Xrcc3Q9CXE6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Xrcc3Q9CXE6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Xrcc3Q9CXE6 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Xrcc3Q9CXE6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Xrcc3Q9CXE6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
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Xrcc3Q9CXE6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Xrcc3Q9CXE6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Xrcc3Q9CXE6 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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