Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Cdca4Q9CWM2 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Cdca4Q9CWM2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms