Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sppl3Q9CUS9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms