Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms