Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rhobtb3Q9CTN4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms