Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snw1Q9CSN1 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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