Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Q9CRC3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms