Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Higd2aQ9CQJ1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Higd2aQ9CQJ1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms