Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQC3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CQC3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms