Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
StambpQ9CQ26 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
StambpQ9CQ26 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms