Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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Chmp3Q9CQ10 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Chmp3Q9CQ10 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Chmp3Q9CQ10 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Chmp3Q9CQ10 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Chmp3Q9CQ10 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Chmp3Q9CQ10 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Chmp3Q9CQ10 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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Chmp3Q9CQ10 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Chmp3Q9CQ10 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Chmp3Q9CQ10 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms