Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cdh23Q99PF4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh23Q99PF4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh23Q99PF4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh23Q99PF4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh23Q99PF4 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh23Q99PF4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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