Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tsnaxip1Q99P25 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms