Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sf3b1Q99NB9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sf3b1Q99NB9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms