Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ms4a4dQ99N05 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms