Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramel1Q99MW3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms