Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpgs1Q99MS8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms