Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atp1b4Q99ME6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atp1b4Q99ME6 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms