Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtprtQ99M80 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PtprtQ99M80 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms