Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt84Q99M73 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt84Q99M73 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms