Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pagr1aQ99L02 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms