Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Reep3Q99KK1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Reep3Q99KK1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Reep3Q99KK1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Reep3Q99KK1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Reep3Q99KK1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Reep3Q99KK1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Reep3Q99KK1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Reep3Q99KK1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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