Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Usp11Q99K46 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Usp11Q99K46 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms