Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Kdelr1Q99JH8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms