Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Apobec3Q99J72 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Apobec3Q99J72 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms