Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn16Q925N4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn16Q925N4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn16Q925N4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Cldn16Q925N4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Cldn16Q925N4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cldn16Q925N4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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