Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trim59Q922Y2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms