Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Odf3Q920N1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Odf3Q920N1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Odf3Q920N1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Odf3Q920N1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Odf3Q920N1 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Odf3Q920N1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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