Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf6Q91YR7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms