Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Usp3Q91W36 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usp3Q91W36 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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