Protein–RNA interactions for Protein: Q91W18

Tdrd3, Tudor domain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd3Q91W18 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tdrd3Q91W18 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms