Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37863-201ENSMUST00000194911 1457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21139-201ENSMUST00000186594 877 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms