Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39cQ8VE09 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc39cQ8VE09 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc39cQ8VE09 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc39cQ8VE09 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc39cQ8VE09 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc39cQ8VE09 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ttc39cQ8VE09 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc39cQ8VE09 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ttc39cQ8VE09 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ttc39cQ8VE09 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms