Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam20bQ8VCS3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam20bQ8VCS3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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