Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd300ldQ8VCH2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms