Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC66

Ssx2ip, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx2ipQ8VC66 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ssx2ipQ8VC66 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms