Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ApobrQ8VBT6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms